第一部　興福寺と藤原氏
氏長者と勧学院（大学別曹としての勧学院／勧学院の興福寺・春日社の管掌／「勧学院」と南曹弁）
藤氏長者宣と氏長者（「藤氏長者宣」の形態／南曹弁と文書／興福寺と藤氏長者）

第二部　門跡の組織と経営
一乗院・大乗院院主の相承（「院主次第」／院家領の変遷と集積／院主の相承）
門跡の組織（寺僧の身分構成／大乗院家の構成）
門跡と評定衆（「門跡評定」／「院務始」と評定／門主と評定衆）
坊官の記録（禅南院清玄の記録／坊官と記録）

第三部　門跡と教学
門跡の修学（「学問初」と「師範」／門跡と「同学」／門跡の法会出仕と修学）
中世維摩会の変遷と門跡（維摩会の変容と僧綱位／維摩会関係の記録と相伝／門跡と維摩会）
興福寺門跡と「二明聖教」（大乗院門跡による正願院経蔵の相承／「二明重書」とは／門跡と聖教）